מחלוקת גאונים היא אם נושאים הכהנים את כפיהם במנחה של יום הכיפורים. דעתם של רב אחאי גאון, בה"ג, ר"ח ועוד היא שנושאים את כפיהם במנחה, ודעת גאוני סורא היא שאין נושאים את כפיהם. אבל דעת ומנהג כל חכמי א"י שנושאים את כפיהם במנחה של תענית, כמפורש בחילופי המנהגים שבין א"י לבבל. גם בספרד היו נוהגים בעבר כחכמי א"י, עד ששינו את מנהגם לנהוג כחכמי סורא.
ולכן כיון שמנהג עתיק הוא, וכהן שעלה אין מורידים אותו, יכולים הכהנים לעלות לדוכן ביום הכיפורים בא"י, אם אין בציבור עמי הארץ המעוררים מחלוקת בדבר. שאין לעורר סביב "וישם לך שלום" מחלוקת, ובמיוחד ביום הכיפורים.
ומנהגנו הוא לשאת כפיים במנחה של יוה"כ.