שולחן ערוך

סעיף כג :
יכול ליתן בתוכו מים או יין לצחצחו. אבל מי רגלים אף בחול אסור, מפני הכבוד.
עץ אר"ז

כלומר, מותר לנקות את השופר ביום טוב, ואין זה נחשב שהוא מתקן את השופר ביום טוב. אך יש לשים לב שהשופר יתייבש היטב לפני תקיעת שופר, כי עלול התוקע לא להצליח לתקוע בו אם הוא רטוב.